灌水器一旦堵塞，会引起配水不均、系统性能下降，甚至造成整个系统瘫痪，这样就不得不耗费大量人力和财力来排除堵塞或重建系统。因此为防止灌水器堵塞和投资浪费，任何微灌系统都必须合理配置过滤设备。在选择过滤设备之前，应首先确定以下因素：
       1、弄清楚灌溉水中含有哪些杂质。通过水质化验可获得杂质的粒径、物理特性、浓度等指标，这些指标将决定所选过滤器型式及其维护方式。
       2、确定所选灌水器的流道直径，将用此直径选定过滤器的过滤能力。
       3、确定灌溉系统的峰值流量，将用此流量选择过滤器的过滤容量。
       4、进行造价比较。若选定了一种过滤器，但必须把自动控制和维护管理费用加进总造价中，进行经济比较后选择合适的过滤系统。
       所选过滤器的目数即过滤器的过滤能力取决于灌水器的流道直径，大量观测数据表明，仅七、八个悬浮固体颗粒就可在流道出口处形成一个弧形堆积带，从而引起灌水器堵塞。要防止这种弧形堆积带的形成，对于微喷系统的过滤器，必须能将大于1/7喷咀直径的杂质全部滤掉；对采用长流道滴头的滴灌系统，过滤器的过滤能力务必达到能将大于1/10滴孔直径的杂质全部滤出。对于不同的微灌系统，过滤器的滤孔直径可用公式表示如下：
                            微喷系统： dL=dP/7  ……………… (1)
                            滴灌系统： dL=dD/10 ……………… (2)
                            式中 dL — 滤孔直径（mm）
                                   dP — 微喷头喷咀直径（mm）
                                   dD — 滴头滴孔直径（mm）
       表1给出滤孔直径与滤网目数的对应关系，设计中可参考查用。网式和叠片式过滤器的过滤能力通常以目数表示，而砂石过滤器则用过滤砂的标号表示过滤能力，因此查出目数后还需从表7中查出对应该目数的过滤砂的标号。

      在此给出不同水质条件下的常用过滤器型式（见表2），此表把水质作为主要影响因素，也许再考虑其它影响因素选出的过滤器型式与该表中所列的有所不同，例如水中有机和无机物含量均小于5 mg/L，按此表选用手动冲洗网式过滤器即可，若整个系统采用自动控制，考虑自控的要求，就需选用自动冲洗网式过滤器，表2仅供设计中参考。表3列出一些厂家微灌设备所推荐的过滤要求，以便工程设计中查用。